Anna-Sapfo Malaspinas

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Version du 18 mais 2017

Anna-Sapfo Malaspinas, professeure assistante

Spécialiste en biologie computationnelle et évolutive, Anna-Sapfo Malaspinas s’intéresse tout particulièrement à la génétique des populations, notamment à partir de l’analyse de l’ADN ancien. Elle a été nommée professeure assistante en prétitularisation conditionnelle au rang de professeure associée au Département de biologie computationnelle de l’UNIL dès le 1er mai 2017.

Les travaux de recherche d’Anna-Sapfo Malaspinas se focalisent sur des questions de génétique théorique des populations, et en particulier sur l’analyse de l’ADN ancien1. L’approche de la scientifique combine le développement d’outils computationnels innovants et de nouvelles théories évolutives avec l’analyse de données à grande échelle, telles que le séquençage du génome à haut débit et notamment à partir de génomes anciens. Un de ses axes de recherche consiste à mieux comprendre comment les humains ont colonisé le monde et se sont adaptés aux nouveaux environnements qu’ils rencontraient. Un grand nombre de méthodes existent actuellement pour caractériser l’évolution des populations, mais plutôt à partir d’échantillons d’ADN contemporain. La jeune professeure vise à développer de nouveaux outils et modèles mathématiques et computationnels applicables à l’ADN ancien, provenant par exemple de momies des Andes ou de l’Île de Pâques. En effet, un projet sur lequel travaille la scientifique consiste à caractériser un potentiel contact entre les habitants de ces deux régions du monde. À partir de données anciennes et actuelles issues du génome de ces populations et grâce à des méthodes statistiques innovantes, Anna-Sapfo Malaspinas a pour objectif de déterminer le moment et le lieu de premier contact de ces deux peuplades. Ses travaux de recherche devraient bénéficier non seulement au domaine émergent que constitue l’analyse des génomes anciens, mais aussi à la biologie évolutive en général. La nomination d’Anna-Sapfo Malaspinas à Lausanne devrait donc permettre de renforcer ces deux disciplines à l’UNIL et de participer ainsi au développement du nouveau Département de biologie computationnelle.

L’expertise d’Anna-Sapfo Malaspinas est reconnue au niveau international et a déjà été récompensée, entre autres, par plusieurs financements du Fonds national suisse pour la recherche scientifique (SNSF) et une bourse ERC Starting Grant obtenue en 2016. La scientifique a publié une trentaine d’articles dans des revues scientifiques de référence, telles que Plos Biology (2007), Theoretical Population Biology (2011), Genetics (2012), Science (2010), PNAS (2014), Current Biology (deux publications en 2014) et Nature (2016). Elle est par ailleurs très impliquée dans l’enseignement pré- et post-gradué et a supervisé plusieurs étudiants en Master et en doctorat.

1ADN ancien : ADN provenant d’espèces éteintes ou d’organismes morts depuis très longtemps.

Bio express

1982 Naissance en Suisse
2006 Master en biologie, Université de Genève (UNIGE)
2008 Master en physiques et mathématiques, UNIGE
2011 Thèse de doctorat en biologie intégrative (biologie génomique et computationnelle), UC Berkley, Etats-Unis
2011-2014 Post-doctorat puis professeure assistante (2014), Centre de géogénétique, Musée d’histoire naturelle du Danemark, Université de Copenhague, Danemark
2015 Cheffe de groupe junior bénéficiaire d’une bourse SNSF Ambizione, Institut d’écologie et d’évolution, Université de Berne
2016 Professeure assistante (2016), Institut d’écologie et d’évolution, Université de Berne
dès 2016 Cheffe de groupe à l’Institut suisse de bioinformatique (SIB)
dès 2017 Professeure assistante PTC au Département de biologie computationnelle de l’UNIL

Par: Caroline Ronzaud/Communication FBM

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